MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017857	CCA	2	6	128262	128267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126025
2503	NC_017857	GCA	2	6	128375	128380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126025
2504	NC_017857	ATTTT	2	10	128394	128403	20 %	80 %	0 %	0 %	387126025
2505	NC_017857	TCG	2	6	128503	128508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126025
2506	NC_017857	CAA	2	6	128522	128527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126025
2507	NC_017857	AAC	2	6	128610	128615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126025
2508	NC_017857	TAAAA	2	10	128647	128656	80 %	20 %	0 %	0 %	387126026
2509	NC_017857	A	7	7	128653	128659	100 %	0 %	0 %	0 %	387126026
2510	NC_017857	TTGA	2	8	128660	128667	25 %	50 %	25 %	0 %	387126026
2511	NC_017857	GAA	2	6	128714	128719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126026
2512	NC_017857	CAA	3	9	128756	128764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126026
2513	NC_017857	TGC	2	6	128770	128775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126026
2514	NC_017857	GCA	2	6	128792	128797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
2515	NC_017857	CAG	3	9	128841	128849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
2516	NC_017857	CAA	2	6	128850	128855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126026
2517	NC_017857	TCT	2	6	128858	128863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126026
2518	NC_017857	TCACCC	2	12	128912	128923	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	387126026
2519	NC_017857	GCT	2	6	128930	128935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126026
2520	NC_017857	CAG	2	6	128951	128956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
2521	NC_017857	GTGAT	2	10	128967	128976	20 %	40 %	40 %	0 %	387126026
2522	NC_017857	CAT	2	6	128980	128985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126026
2523	NC_017857	AAT	2	6	129099	129104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126026
2524	NC_017857	ACA	2	6	129153	129158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126027
2525	NC_017857	TGAT	2	8	129159	129166	25 %	50 %	25 %	0 %	387126027
2526	NC_017857	TGA	2	6	129292	129297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126027
2527	NC_017857	GCC	2	6	129362	129367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126027
2528	NC_017857	TTTATT	2	12	129455	129466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387126027
2529	NC_017857	ATG	2	6	129491	129496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126027
2530	NC_017857	GACCA	2	10	129581	129590	40 %	0 %	20 %	40 %	387126027
2531	NC_017857	ATC	2	6	129626	129631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126027
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2533	NC_017857	CGT	2	6	129857	129862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126027
2534	NC_017857	GTC	2	6	129872	129877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126027
2535	NC_017857	GAA	2	6	129878	129883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126027
2536	NC_017857	GTG	2	6	129966	129971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126027
2537	NC_017857	CAT	2	6	130138	130143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126027
2538	NC_017857	CTGGT	2	10	130209	130218	0 %	40 %	40 %	20 %	387126027
2539	NC_017857	CCA	2	6	130289	130294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126027
2540	NC_017857	GAAA	2	8	130375	130382	75 %	0 %	25 %	0 %	387126027
2541	NC_017857	GGT	2	6	130454	130459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126027
2542	NC_017857	CGTT	2	8	130502	130509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_017857	GCA	2	6	130545	130550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126028
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2545	NC_017857	GACA	2	8	130698	130705	50 %	0 %	25 %	25 %	387126028
2546	NC_017857	CTG	2	6	130714	130719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
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2548	NC_017857	ATGG	2	8	130797	130804	25 %	25 %	50 %	0 %	387126028
2549	NC_017857	GCC	2	6	130863	130868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126028
2550	NC_017857	CTG	2	6	130891	130896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
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2552	NC_017857	TGAT	2	8	130988	130995	25 %	50 %	25 %	0 %	387126028
2553	NC_017857	GCC	3	9	131026	131034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126028
2554	NC_017857	CTG	2	6	131035	131040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
2555	NC_017857	ATC	2	6	131122	131127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126028
2556	NC_017857	ACCT	2	8	131131	131138	25 %	25 %	0 %	50 %	387126028
2557	NC_017857	GCTA	2	8	131175	131182	25 %	25 %	25 %	25 %	387126028
2558	NC_017857	TTG	2	6	131222	131227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126028
2559	NC_017857	AC	3	6	131243	131248	50 %	0 %	0 %	50 %	387126028
2560	NC_017857	CAGC	2	8	131292	131299	25 %	0 %	25 %	50 %	387126028
2561	NC_017857	GAA	2	6	131341	131346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126028
2562	NC_017857	ATTT	2	8	131418	131425	25 %	75 %	0 %	0 %	387126029
2563	NC_017857	TGG	2	6	131493	131498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126029
2564	NC_017857	TAA	2	6	131518	131523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126029
2565	NC_017857	A	6	6	131540	131545	100 %	0 %	0 %	0 %	387126029
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2569	NC_017857	A	6	6	131693	131698	100 %	0 %	0 %	0 %	387126029
2570	NC_017857	TGGC	2	8	131712	131719	0 %	25 %	50 %	25 %	387126029
2571	NC_017857	CTGG	2	8	131811	131818	0 %	25 %	50 %	25 %	387126029
2572	NC_017857	AAT	2	6	131825	131830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126029
2573	NC_017857	AAATC	2	10	131949	131958	60 %	20 %	0 %	20 %	387126029
2574	NC_017857	TTG	2	6	132014	132019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126029
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2576	NC_017857	TGA	2	6	132048	132053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126029
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2579	NC_017857	AC	3	6	132177	132182	50 %	0 %	0 %	50 %	387126029
2580	NC_017857	GCAATG	2	12	132258	132269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387126029
2581	NC_017857	CAA	2	6	132278	132283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126029
2582	NC_017857	T	6	6	132332	132337	0 %	100 %	0 %	0 %	387126029
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2585	NC_017857	AAC	2	6	132485	132490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126030
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2587	NC_017857	GCT	2	6	132595	132600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126030
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2589	NC_017857	TGA	2	6	132688	132693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126031
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2593	NC_017857	CGG	2	6	132791	132796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126031
2594	NC_017857	AAG	2	6	132835	132840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126031
2595	NC_017857	AC	3	6	132848	132853	50 %	0 %	0 %	50 %	387126031
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2599	NC_017857	GTC	2	6	132922	132927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126031
2600	NC_017857	GAC	2	6	132939	132944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126031
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2602	NC_017857	GTG	2	6	132984	132989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126031
2603	NC_017857	ATATTG	2	12	133054	133065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387126031
2604	NC_017857	TGCG	2	8	133081	133088	0 %	25 %	50 %	25 %	387126031
2605	NC_017857	GTT	3	9	133116	133124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126031
2606	NC_017857	CG	3	6	133141	133146	0 %	0 %	50 %	50 %	387126031
2607	NC_017857	GAT	2	6	133179	133184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126031
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2619	NC_017857	TGATTT	2	12	133790	133801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387126031
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2987	NC_017857	CCA	2	6	153506	153511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126049
2988	NC_017857	AT	3	6	153559	153564	50 %	50 %	0 %	0 %	387126049
2989	NC_017857	CAAT	2	8	153590	153597	50 %	25 %	0 %	25 %	387126049
2990	NC_017857	TGG	2	6	153600	153605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126049
2991	NC_017857	ACC	2	6	153613	153618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126049
2992	NC_017857	TGA	2	6	153638	153643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126049
2993	NC_017857	CTG	2	6	153651	153656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126049
2994	NC_017857	TTATC	2	10	153695	153704	20 %	60 %	0 %	20 %	387126049
2995	NC_017857	TCT	2	6	153910	153915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126049
2996	NC_017857	TGAC	2	8	153925	153932	25 %	25 %	25 %	25 %	387126049
2997	NC_017857	ACG	2	6	154041	154046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126049
2998	NC_017857	TAA	2	6	154059	154064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126049
2999	NC_017857	AATG	2	8	154171	154178	50 %	25 %	25 %	0 %	387126049
3000	NC_017857	TCT	2	6	154228	154233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126049

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